بخش قارچ شناسی آزمایشگاه تهرانسر با نیروی مجرب و کارآزموده یکی از مراکز مجهز و تخصصی قارچ شناسی در کشور می باشد. این بخش با مسئولیت سرکار خانم دکترصاقی دارای مدرک تحصیلی PHD قارچ شناسی ضمن ارائه خدمت به بیماران در زمینه قارچ شناسی به طور مرتب در نشریه های علوم آزمایشگاهی در زمینه آموزش و ارتقاء سطح کیفی این دانش حضور فعال و مستمر نیز دارند. این بخش با تهیه کلیه محیط های افتراقی و کشت قارچ شناسی به طور تخصصی برای تشخیص انواع قارچ ها فعالیت چشمگیر داشته است.